Film animasi petualangan ini mengikuti kisah Dave, makhluk unik bernama Nestrian yang mirip aardvark berwarna cerah, bersama putranya, Finny. Dave dikenal jago membuat sarang, tapi punya kebiasaan unik, mengeluarkan gas biru berbau saat emosional. Mereka terus berpindah-pindah, membuat Finny kesulitan punya teman dan tempat yang benar-benar terasa seperti rumah.

Suatu hari, mereka mendengar kabar tentang banjir besar yang akan menenggelamkan dunia. Satu-satunya harapan adalah sebuah bahtera raksasa yang menampung semua hewan. Dengan kecerdikan dan bantuan tak terduga dari Hazel dan anaknya Leah, makhluk mirip serigala bernama Grymp, Dave dan Finny berhasil menyelinap masuk ke dalam bahtera.

Namun, masalah muncul saat Finny dan Leah justru terpisah dari bahtera akibat rasa penasaran mereka. Saat gelombang besar datang, kapal berlayar pergi, meninggalkan mereka di daratan yang perlahan tenggelam. Petualangan bertahan hidup pun dimulai, di mana Finny yang awalnya canggung justru mulai menunjukkan keberanian luar biasa.

Di sisi lain, Dave dan Hazel harus bekerja sama meski sering berselisih. Mereka menghadapi berbagai rintangan di dalam bahtera, termasuk penjaga gorila dan kapten singa yang arogan, demi mengambil alih kendali kapal dan menyelamatkan anak- anak mereka.

Sementara itu, Finny dan Leah menghadapi bahaya dari makhluk predator dan kondisi alam ekstrem. Dalam situasi genting, terungkap fakta mengejutkan bahwa Nestrian sebenarnya adalah makhluk air, mampu berenang dan bernapas di dalam air. Fakta ini menjelaskan mengapa Dave selama ini tak pernah merasa benar-benar "di rumah".

Akhirnya, keluarga mereka kembali bersatu. Bahtera berhasil mencapai daratan aman, dan Dave serta Finny menemukan habitat asli mereka di laut. Film ini ditutup dengan momen hangat ketika mereka membantu teman- temannya belajar berenang, menandai awal kehidupan baru yang penuh harapan.