Film ini mengangkat kisah Ramayana dengan sudut pandang yang lebih berpihak pada Sita. Cerita dimulai saat Pangeran Rama diasingkan dari kerajaan Ayodhya akibat tipu daya Ratu Kaikeyi yang ingin putranya menjadi pewaris tahta. Meski hutan penuh bahaya, Sita memilih ikut menemani suaminya menjalani pembuangan.

Kecantikan Sita kemudian terdengar sampai ke telinga raja iblis Ravana. Dengan bantuan tipu muslihat rusa emas, Rama dipancing menjauh dari tempat tinggal mereka. Saat Rama pergi, Ravana menculik Sita dan membawanya ke kerajaannya. Meski diancam dan dibujuk, Sita tetap setia menunggu Rama datang menyelamatkannya.

Dengan bantuan Hanuman dan pasukan kera, Rama akhirnya menemukan lokasi Sita dan mengalahkan Ravana. Namun setelah kembali, rakyat Ayodhya meragukan kesetiaan Sita selama ditawan. Untuk membuktikan dirinya suci, Sita menjalani ujian api dan para dewa turun tangan menyatakan bahwa ia tetap murni dan setia.

Sita kembali ke istana dan tengah mengandung, tetapi Rama kembali goyah setelah mendengar rakyat mencela perempuan tak setia. Ia pun memerintahkan Lakshman meninggalkan Sita di hutan. Di sana, Sita melahirkan putra kembar, Lava dan Kusha, lalu membesarkan mereka dengan penuh kasih sambil tetap menghormati nama ayah mereka.

Bertahun-tahun kemudian, Rama bertemu kembali dengan anak-anaknya dan menemukan Sita. Namun kecewa atas perlakuan Rama, Sita memohon kepada Dewi Bumi agar menelannya sebagai bukti terakhir kesucian dan pengorbanannya. Permintaan itu pun dikabulkan.

Film ini juga menampilkan kisah modern sang animator Nina Paley. Ia ditinggal suaminya yang bekerja di India dan perlahan menyadari pernikahan mereka berakhir. Dalam kesedihan, Nina menemukan penghiburan lewat kucing barunya dan mempelajari kisah Ramayana, yang paralel dengan penderitaan Sita.