Film aksi sejarah Jepang 11 Rebels mengambil latar masa kelam Perang Boshin, perang saudara besar yang mengguncang Jepang pada akhir era samurai. Cerita berpusat pada pengkhianatan klan Shibata di wilayah Niigata, ketika kekuasaan lama shogun mulai runtuh dan pemerintahan baru berusaha mengambil alih Jepang.

Di tengah konflik berdarah tersebut, terbentuk sebuah pasukan bunuh diri berisi 11 orang dengan misi nyaris mustahil, yaitu mempertahankan sebuah benteng penting dari serangan musuh. Mereka harus bertarung di tengah kekacauan perang, pengkhianatan, dan perebutan kekuasaan yang mengancam nyawa kapan saja.

Meski sadar peluang untuk selamat sangat kecil, kesebelas pejuang itu tetap maju demi kehormatan dan keyakinan mereka. Pertempuran yang mereka hadapi pun berubah menjadi kisah heroik tentang keberanian, pengorbanan, dan kesetiaan di tengah runtuhnya era lama Jepang.