HUNT berlatar era 1980-an saat Korea Selatan masih berada di bawah rezim militer. Park Pyong- ho (Lee Jung-jae), kepala unit luar negeri ANSP, dan Kim Jung-do (Jung Woo-sung), kepala unit domestik, ditugaskan melindungi Presiden Chun Doo-hwan di Washington DC. Namun misi itu berubah kacau ketika muncul percobaan pembunuhan oleh tim pembunuh bayaran. Setelah insiden berdarah tersebut, keduanya mulai saling curiga dan menyalahkan satu sama lain.

Sekembalinya ke Korea, mereka mendapat tugas baru untuk memburu mata-mata Korea Utara bernama Donglim yang diyakini telah menyusup ke tubuh intelijen Korea Selatan. Pyong-ho dan Jung- do mulai melakukan investigasi besar-besaran sambil saling mengawasi. Situasi makin rumit ketika operasi rahasia militer Korea Selatan bocor dan berakhir dengan kegagalan fatal yang menewaskan seluruh pasukan infiltrasi.

Di tengah penyelidikan, seorang ilmuwan nuklir Korea Utara yang hendak membelot justru tewas dalam operasi penyelamatan yang berantakan. Kecurigaan antara Pyong-ho dan Jung-do makin memanas. Mereka juga harus menghadapi pengkhianatan, interogasi brutal, hingga permainan politik yang penuh manipulasi di dalam lembaga keamanan negara.

Perlahan terungkap fakta mengejutkan bahwa Kim Jung-do ternyata terlibat gerakan pemberontakan rahasia yang ingin membunuh Presiden Korea Selatan sebagai balas dendam atas tragedi pembantaian Gwangju. Sementara itu, Park Pyong-ho justru terbongkar sebagai Donglim, mata-mata Korea Utara yang selama ini dicari. Meski berada di pihak berbeda, keduanya akhirnya bekerja sama dalam rencana pembunuhan presiden di Bangkok.

Rencana itu berubah menjadi kekacauan besar ketika Pyong-ho memilih menggagalkan serangan demi mencegah invasi Korea Utara ke Selatan. Jung-do tewas dalam ledakan, sementara Pyong-ho mencoba menyelamatkan Yoo- jeong (Jeon Hye-jin), agen Korea Utara yang diam-diam ia pedulikan. Namun di akhir cerita, Pyong-ho justru dibunuh oleh agen Korea Utara lainnya setelah identitasnya tak lagi berguna.