INTERCEPTOR mengikuti kisah Kapten JJ Collins (Elsa Pataky), perwira Angkatan Darat Amerika Serikat yang dipindahkan ke sebuah pangkalan pencegat rudal nuklir di tengah Samudra Pasifik. Mutasi itu terjadi setelah ia melaporkan kasus pelecehan seksual yang melibatkan atasannya. Di tempat terpencil tersebut, Collins bekerja bersama Rahul Shah (Mayen Mehta) dan Beaver Baker (Luke Bracey) menjaga sistem pertahanan terakhir Amerika dari ancaman serangan nuklir.

Situasi berubah mencekam ketika markas pertahanan rudal di Alaska diserang kelompok teroris pimpinan Alexander Kessel (Luke Bracey). Di saat bersamaan, 16 hulu ledak nuklir Rusia dicuri dan diarahkan ke kota-kota besar Amerika Serikat. Kelompok Kessel kemudian menyusup ke pangkalan Collins dengan tujuan melumpuhkan sistem pencegat rudal agar serangan nuklir bisa berjalan tanpa hambatan.

Satu per satu personel pangkalan dibunuh hingga hanya Collins dan beberapa orang yang tersisa. Collins harus bertahan hidup sambil menghadapi pengkhianatan dari dalam timnya sendiri. Kessel bahkan menyiarkan ancaman global dan menyebut kota-kota Amerika yang akan dihancurkan jika misi mereka berhasil.

Di tengah situasi yang semakin kacau dan pangkalan yang perlahan tenggelam, Collins berusaha menghentikan peluncuran rudal nuklir dengan segala cara. Pertarungan brutal pun terjadi antara Collins dan para teroris di dalam markas sempit yang penuh tekanan. Dengan waktu yang terus berjalan, ia menjadi satu-satunya harapan untuk mencegah bencana besar.

Pada akhirnya, Collins berhasil meluncurkan rudal pencegat tepat waktu dan menggagalkan serangan nuklir mematikan tersebut. Setelah melewati perjuangan berat, ia selamat dan mendapat penghargaan langsung dari Presiden Amerika Serikat atas keberaniannya menyelamatkan jutaan nyawa.