THE PIRATES: THE LAST ROYAL TREASURE mengikuti petualangan Moo-chi (Kang Ha-neul), pemimpin kelompok bandit yang mengaku sebagai pendekar pedang terbaik di Goryeo. Dalam perjalanannya, ia bertemu dengan Hae-rang (Han Hyo-joo), kapten kapal bajak laut yang terkenal tangguh dan berhasil menguasai lautan. Meski sering bertengkar dan memiliki sifat yang bertolak belakang, keduanya akhirnya terlibat dalam perjalanan besar yang penuh bahaya.

Suatu hari, mereka menemukan petunjuk tentang harta kerajaan yang hilang tanpa jejak selama bertahun-tahun. Harta legendaris itu diyakini tersembunyi di suatu tempat misterius dan menjadi incaran banyak pihak. Moo-chi dan Hae-rang kemudian memimpin kru mereka berlayar untuk mencari kekayaan terbesar yang pernah ada dalam dunia bajak laut.

Perjalanan mereka dipenuhi berbagai rintangan mulai dari badai laut, jebakan mematikan, hingga pertarungan sengit melawan musuh. Di tengah pencarian itu, hubungan Moo-chi dan Hae-rang juga semakin dekat meski keduanya terus saling adu ego dan keras kepala.

Namun mereka bukan satu-satunya yang memburu harta tersebut. Bu Heung-soo (Kwon Sang-woo), pengkhianat kejam yang haus kekuasaan, ikut turun ke laut demi mendapatkan harta kerajaan untuk dirinya sendiri. Ia siap melakukan apa saja, termasuk mengkhianati dan membunuh siapa pun yang menghalanginya.

Pertarungan besar pun tak terhindarkan saat para pemburu harta saling berebut menemukan lokasi terakhir harta kerajaan. Dengan aksi seru, komedi, dan petualangan menegangkan, Moo-chi dan Hae-rang harus bekerja sama demi bertahan hidup sekaligus menemukan harta legendaris yang selama ini dicari.