Transformers: Rise of the Beasts menghadirkan babak baru dunia Transformers lewat Noah Diaz yang diperankan Anthony Ramos, Elena Wallace oleh Dominique Fishback, serta deretan Autobots dan Maximals ikonis seperti Optimus Prime bersuara Peter Cullen, Mirage bersuara Pete Davidson, Bumblebee, Arcee, Airazor bersuara Michelle Yeoh, dan Optimus Primal bersuara Ron Perlman. Transformers: Rise of the Beasts membawa kita ke konflik kosmik yang lebih besar, mempertemukan Autobots dan Maximals demi menyelamatkan Bumi dari ancaman pemakan planet.

Kisah dibuka dengan teror Unicron, Transformer raksasa yang melahap planet, saat ia menghancurkan dunia asal Maximals. Demi mempercepat kehancuran semesta, Unicron mengutus herald-nya, Scourge, bersama Terrorcons untuk merebut Transwarp Key, artefak yang mampu membuka portal ruang dan waktu. Pemimpin Maximals, Apelinq, mengorbankan diri agar kaumnya bisa melarikan diri. Kepemimpinan kemudian jatuh ke Optimus Primal, yang membawa para Maximals menuju Bumi sambil menyembunyikan kunci tersebut.

Cerita lalu beralih ke Brooklyn tahun 1994. Noah Diaz, mantan personel militer dengan keahlian elektronik, kesulitan mencari pekerjaan demi menghidupi adiknya, Kris, yang sakit. Terdesak keadaan, Noah tergoda ajakan temannya, Reek, untuk mencuri sebuah Porsche. Tanpa disangka, mobil itu ternyata Mirage, Autobot dengan kemampuan kamuflase. Di sisi lain, Elena Wallace, seorang magang museum, meneliti patung elang kuno berlogo Maximals dan tanpa sengaja memecahkannya hingga menemukan Transwarp Key tersembunyi di dalamnya.

Aktivasi kunci memancarkan energi yang terdeteksi Optimus Prime. Ia segera memanggil Autobots lain, termasuk Arcee dan Bumblebee. Mirage yang tengah berurusan dengan Noah pun menyeret manusia itu masuk ke dalam misi Autobots untuk merebut kunci, dengan harapan bisa kembali ke Cybertron. Namun sinyal energi tersebut juga menarik kedatangan Terrorcons ke Bumi. Pertempuran sengit pecah di sekitar museum, menyeret Elena ke dalam konflik. Dalam kekacauan itu, Scourge membunuh Bumblebee dan merebut kunci, sebelum mundur saat Airazor muncul menahan mereka.

Airazor mengungkap bahwa Maximals telah lama bersembunyi di Bumi dan Transwarp Key sebenarnya terbelah dua demi keamanan. Optimus Prime bersikeras menyatukan kembali kunci demi pulang ke Cybertron, sementara Noah diam-diam berniat menghancurkannya agar Bumi tetap aman. Petunjuk Elena membawa mereka ke sebuah kuil tersembunyi di Peru. Dengan bantuan Autobot Stratosphere, mereka bertemu Wheeljack dan melanjutkan pencarian. Namun setengah kunci kedua ternyata sudah tidak berada di sana.