Dari perkawinannya dengan Indraguna Sutowo, Dian Sastrowardoyo telah memiliki dua orang anak yang lucu. Mereka adalah Syailendra Sutowo (3 tahun) dan Ariandra Nariratana (1 tahun). Memiliki anak yang masih begitu kecil, Dian kerap berbagi momen bersama.