Jailer dibuka dengan sosok "Tiger" Muthuvel Pandian yang diperankan Rajinikanth, hidup tenang bersama istrinya Vijaya yang dimainkan Ramya Krishnan, cucunya Rithvik, serta menantunya Swetha yang diperankan Mirnaa, sementara putranya ACP Arjun yang diperankan Vasanth Ravi dikenal sebagai polisi jujur dan berani. KLovers langsung diajak melihat kontras antara kehidupan keluarga yang hangat dengan dunia kriminal gelap yang sedang diburu Arjun. Ia tengah menyelidiki Varman yang diperankan Vinayakan, seorang gangster eksentrik yang menyelundupkan arca dewa dari Arakkonam ke luar negeri. Saat Arjun semakin dekat menangkap Varman, ia tiba-tiba menghilang dan kepolisian menutupinya dengan kabar bahwa Arjun bunuh diri karena tekanan pekerjaan.

Jailer kemudian membawa kita ke fase duka Muthuvel yang terpukul kehilangan anaknya. Ia menyalahkan dirinya sendiri karena mendidik Arjun menjadi polisi lurus tanpa kompromi. Amarah itu memuncak ketika ia melacak Seenu, anak buah Varman, lalu membunuhnya dengan dingin. Muthuvel memaksa Vimal yang diperankan Yogi Babu, seorang sopir taksi polos, membantu menghilangkan jasad Seenu. Tindakan ini memicu serangan balasan dari Varman yang menargetkan cucu Muthuvel, Rithvik. Upaya pembunuhan itu gagal, tetapi menjadi titik balik ketika Muthuvel sadar bahwa permohonan damai tidak akan menghentikan musuhnya.

Muthuvel lalu memilih melawan dengan caranya sendiri. Ia memeras seorang psikiater bernama S. Dhandapani demi mengamankan keluarganya, lalu menemui Narasimha yang diperankan Mohanlal, mantan kriminal yang telah bertobat dan kini hidup sederhana di Mandya. Dari Narasimha, Muthuvel mendapatkan dukungan empat penembak jitu. Bersama mereka, Muthuvel menggagalkan penyelundupan arca milik Varman dan membalikkan keadaan dengan mempermalukan sang gangster menggunakan barang selundupan itu sebagai alat pemerasan.

Balasan Varman tak kalah brutal. Tiga orang kepercayaannya tewas, lalu ia menyewa Kamdev yang diperankan Jackie Shroff, gangster asal Bihar, untuk menghabisi Muthuvel beserta keluarganya. Serangan besar-besaran terjadi di rumah Muthuvel dan membuat keluarganya menyaksikan sisi kelam sang kakek yang selama ini mereka kenal lembut. Di tengah kekacauan, terungkap masa lalu Muthuvel sebagai kepala sipir penjara Tihar yang legendaris. Ia dikenal kejam pada kriminal, namun juga memberi jalan reformasi, sehingga memiliki jaringan loyalis yang luas. Fakta ini menjelaskan mengapa banyak sosok dari berbagai penjuru siap berdiri di sisinya saat perang melawan Varman mencapai puncak.